
基于E2F靶點(diǎn)基因集和免疫...胞癌預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型的建立_何鍶.pdf
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- 基于 E2F 基因 免疫 預(yù)后 風(fēng)險(xiǎn) 評(píng)分 模型 建立
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《基于E2F靶點(diǎn)基因集和免疫亞型差異的肝細(xì)胞癌預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型的建立》講解了利用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的大型HCC隊(duì)列進(jìn)行的研究,該研究通過(guò)一系列生物信息學(xué)分析方法,旨在探索E2F靶點(diǎn)基因集和免疫微環(huán)境相關(guān)基因在肝細(xì)胞癌(HCC)預(yù)后預(yù)測(cè)中的作用。文章描述了如何使用基因集富集分析、單樣本富集分析等技術(shù)手段識(shí)別與HCC密切相關(guān)的基因,并通過(guò)Lasso回歸篩選出七個(gè)關(guān)鍵基因(CYR61、FBLN5、LPA、SAA1、SDC3、SERPINE1和SSRP1)。這七個(gè)基因被用來(lái)構(gòu)建一個(gè)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型,該模型的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分為:-0.55CYR61表達(dá)-0.18FBLN5表達(dá)-0.17LPA表達(dá)-0.06SAA1表達(dá)+0.31SDC3表達(dá)+0.38SERPINE1表達(dá)+1.08SSRP1表達(dá)。研究表明,此評(píng)分模型具有較高的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性,其ROC曲線下的AUC值為0.846,Kaplan-Meier生存曲線顯示高風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分患者預(yù)后較差。此外,多因素Cox回歸分析表明,該模型的預(yù)測(cè)能力獨(dú)立于臨床因素,且在區(qū)分預(yù)后方面優(yōu)于腫瘤大小、UICC分期以外的一些其他因素。最后,研究還通過(guò)聯(lián)合蛋白組學(xué)找到了兩個(gè)關(guān)鍵基因——SERPINE1和LPA,并推測(cè)抑制纖溶酶原激活可能是治療HCC的新途徑。盡管如此,作者也指出,為了進(jìn)一步驗(yàn)證該模型的有效性,仍需要更多多中心的循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。
《基于E2F靶點(diǎn)基因集和免疫亞型差異的肝細(xì)胞癌預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型的建立》適用于從事肝細(xì)胞癌研究的專業(yè)人士,特別是那些專注于癌癥生物學(xué)、分子生物學(xué)和生物信息學(xué)領(lǐng)域的研究人員。對(duì)于臨床醫(yī)生來(lái)說(shuō),尤其是肝膽外科醫(yī)生,本研究提供了新的工具來(lái)評(píng)估患者的預(yù)后風(fēng)險(xiǎn),有助于制定更個(gè)性化的治療方案。同時(shí),該研究也為藥物研發(fā)人員提供了潛在的治療靶點(diǎn),如SERPINE1和LPA,可能成為未來(lái)開(kāi)發(fā)新療法的基礎(chǔ)。此外,參與或有興趣了解癌癥預(yù)后模型構(gòu)建的研究機(jī)構(gòu)和技術(shù)平臺(tái)也可以從這項(xiàng)研究中受益,因?yàn)樗故玖巳绾卫霉矓?shù)據(jù)庫(kù)和先進(jìn)的統(tǒng)計(jì)分析方法來(lái)進(jìn)行癌癥預(yù)后研究。
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